植物總RNA提取試劑盒品牌:genefist | 貨號(hào):TR02
儲(chǔ)存條件
“裂解液RS” 和 “DNase I(DNase I 凍干粉溶解于專用保存液)”,儲(chǔ)存于-20℃。其他試劑室溫(15-25℃)保存。
產(chǎn)品簡介
由于植物的細(xì)胞結(jié)構(gòu)和代謝活性在物種、組織類型和發(fā)育階段之間可能存在顯著差異,因此沒有一種通用的裂解溶液或獨(dú)特的方法可以同樣適用于所有植物樣品。本試劑盒包含兩種可供選擇的裂解緩沖液系統(tǒng):裂解緩沖液 RL(含硫氰酸胍)和裂解緩沖液 RS(含 SDS/抗氧化劑),適用于各種植物和真菌樣品。“裂解液RL”含硫氰酸胍,此提取方案適用于大部分的植物組織,操作簡單快速,但它不適用于富含淀粉、多酚類及多糖類的樣本,因?yàn)榱呀庖篟L加入上述樣本后,會(huì)使樣本變非常粘稠甚至凝固。
“裂解液RS”,采用我司獨(dú)特的“SDS/抗氧化”的方式,可適用于廣泛的植物組織,包含草本植物與本本植物的葉片、具高粘性的多糖多酚類及種子胚乳的植物樣本,此提取方案,增加了額外步驟去除多酚和多糖,RNA的提取總量更高。
本試劑盒提取的總 RNA 純度高,基本沒有基因組、蛋白和其它雜質(zhì)的污染,可用于 PCR、Blot、分子克隆等多種下游實(shí)驗(yàn)。
預(yù)防RNase污染,應(yīng)注意以下幾方面
1.經(jīng)常更換新手套,因?yàn)槠つw經(jīng)常帶有細(xì)菌,可能導(dǎo)致RNase污染。
2.使用無RNase的塑料制品和槍頭避免交叉污染。
3.RNA在裂解液RL中時(shí)不會(huì)被RNase降解。但提取后繼續(xù)處理過程中應(yīng)使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4 h,塑料器皿可在0.5 M NaOH中浸泡10 min,然后用水徹底清洗,再滅菌,即可去除RNase。
4.配制溶液應(yīng)使用無RNase的水(將水加入到干凈的玻璃瓶中,加入DEPC至終濃度0.1%(V/V),高壓滅菌)。
使用前注意事項(xiàng)
1.裂解液 RL:使用前請?zhí)砑?300ul 巰基乙醇,添加過巰基乙醇的裂解液 4℃保存。
2.裂解液 RS:使用前請于 50℃水浴將裂解液完全回溶,并添加 450ul 巰基乙醇;添加過巰基乙醇的裂解液RS 繼續(xù)保存于-20℃(建議將添加過巰基乙醇的裂解液 RS 于無酶管分裝成小量,再保存于-20℃)。
3.溶液 BC:使用前請?zhí)砑?30ml 無水乙醇。
4.漂洗液 PW:使用前請向添加 64ml 無水乙醇。
5.為確保 RNA 的品質(zhì)及產(chǎn)量,應(yīng)盡量收取新鮮的動(dòng)物組織進(jìn)行 RNA 提取,或?qū)⒔M織立即以液氮冷凍,儲(chǔ)存于-70℃,組織亦可保存在 RANstore 樣本保存液(目錄號(hào):TR38)中。
6.鳳梨和蘭花推薦采用“裂解液 RL”。
操作步驟
一、裂解液 RL 操作步驟:
1.勻漿處理
50-100 mg 植物葉片在液氮中迅速研磨成粉末,加入 450ul RL(使用前請先檢查是否已加入 β-巰基乙醇),渦旋劇烈震蕩混勻,并于 56℃孵育 3 分鐘。
注意 1:在 56℃孵育 1-3 min 將有助于植物組織裂解,但是對(duì)于某些富含淀粉的樣品,請不要加熱處理,防止因淀粉引起的樣品膨脹現(xiàn)象。
注意 2:由于植物多樣性非常豐富,而且同種植物的不同生長發(fā)育階段和不同組織的 RNA 含量都不相同,請根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)情況選擇合適的植物材料的用量。
2.將所有溶液轉(zhuǎn)移至過濾柱 CS1 上(過濾柱 CS1 放在收集管中),12,000 rpm(~13,400×g)離心 2-5 min,小心吸取收集管中的上清至 RNase-Free 的離心管中,吸頭盡量避免接觸收集管中的細(xì)胞碎片沉淀。
注意:由于裂解液較粘稠,所以將溶液轉(zhuǎn)移至過濾柱時(shí),可以剪去部分吸頭末端。
3.緩慢加入 0.5 倍上清體積的無水乙醇,混勻(此時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)沉淀),轉(zhuǎn)至“RNA 提取”步驟。
4.將所得“裂解液/乙醇混合液”(含沉淀),移取至吸附柱 CR1 中(吸附柱 CR1 放入收集管中),12,000 rpm(~13,400×g )離心 30-60 sec,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
注意:將溶液和沉淀轉(zhuǎn)移至吸附柱 CR1 時(shí),如果體積大于吸附柱容量,可以分次完成。
5.向吸附柱 CR1 中加入 500ul 溶液 RW,12,000 rpm (~13,400×g )離心離心 1 min,丟棄濾液,將吸附柱CR1 放回收集管中。
6.DNase Ⅰ降解。
每一純化反應(yīng),請將 80 ul DNase 消化液與 10ul DNaseⅠ預(yù)先混合在新的離心管(輕彈或翻轉(zhuǎn)離心管以混合均勻,請勿震蕩),將 90 ul “DNaseⅠ工作液”加入至吸附柱的膜中心,于室溫(25~28℃)孵育15 分鐘。
注意:如同時(shí)操作多組樣本,請使用前現(xiàn)配新鮮的 DNaseⅠ工作液,請勿預(yù)先配制保存 DNaseⅠ工作液。
7.向吸附柱 CR1 中加入 500μl 溶液 RW,12,000 rpm(~13,400×g)離心 1 min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
8.向吸附柱 CR1 中加入 600μl 漂洗液 PW(使用前請先檢查是否已加入乙醇),12,000 rpm(~13,400×g) 離心 1 min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
9.重復(fù)操作步驟 8。
10.12,000 rpm(~13,400×g)離心 3 min,將吸附柱 CR1 置于室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余
的乙醇。
注意:此步驟目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,離心后將吸附柱 CR1 在室溫放置片刻,以充分晾干。如果有漂洗液殘留,可能會(huì)影響后續(xù)的 RT 等實(shí)驗(yàn)。
11.將吸附柱 CR1 轉(zhuǎn)入一個(gè)新的 RNase-Free 離心管中,加入 30-100 μl 無酶雙蒸水至吸附柱的膜中心,室溫靜置 2 min,12,000 rpm(~13,400×g)離心 1 min,得到 RNA 溶液。
注意:洗脫緩沖液體積不應(yīng)少于 30 μl,體積過小影響回收效率;RNA 溶液請于-70℃保存。
二、裂解液 RS 操作步驟
1.勻漿處理:50-100 mg 植物葉片在液氮中迅速研磨成粉末,加入 450 μl 裂解液 RS(使用前請先檢查是否已加入 β-巰基乙醇),立即渦旋劇烈震蕩混勻,并于 56℃孵育 5-10 分鐘,每隔一段時(shí)間可翻轉(zhuǎn)混合離心管。
注意:由于植物多樣性非常豐富,而且同種植物的不同生長發(fā)育階段和不同組織的 RNA 含量都不相同,請根據(jù)具體實(shí)驗(yàn)情況選擇合適的植物材料的用量。
2.加入 150ul 的溶液 GP 至裂解液中,混合均勻,于冰上孵育 5 分鐘,12,000rpm(~13,400×g)離心 5 min。
注意:溶液會(huì)呈現(xiàn)霧狀,為界面活性劑、蛋白質(zhì)、多糖及二次代謝物的沉淀物。
3.移取上清液至過濾柱 CS1 上(過濾柱 CS1 放在收集管中),12,000 rpm(~13,400×g)離心 2 min。
4.小心吸取收集管中的上清至新的 RNase-Free 離心管中,吸頭盡量避免接觸收集管中的細(xì)胞碎片沉淀。
5.向溶液中加入 1.5 倍體積的溶液 BC(已添加無水乙醇),以震蕩或移液器吸吐混合均勻。
注意:加入溶液 BC 后會(huì)形成絲狀沉淀物,不影響 RNA 提取。
6.移取混合液(連同沉淀物一起)至吸附柱 CR1(吸附柱 CR1 放在收集管中),12,000 rpm(~13,400×g) 離心 1 min,丟棄濾液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
注意:如果混合液體積大于吸附柱容量,可以分次完成。
7.向吸附柱 CR1 中加入 500ul 溶液 RW,12,000rpm(~13,400×g)離心 1min,丟棄濾液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
8.DNase Ⅰ降解。
每一純化反應(yīng),請將 80 ul DNase 消化液與 2ul DNaseⅠ預(yù)先混合在新的離心管(輕彈或翻轉(zhuǎn)離心管以混合均勻,請勿震蕩),將 82 ul “DNaseⅠ工作液”加入至吸附柱的膜中心,于室溫(25~28℃)孵育15 分鐘。
注意:如同時(shí)操作多組樣本,請使用前現(xiàn)配新鮮的 DNaseⅠ工作液,請勿預(yù)先配制保存 DNaseⅠ工作液。
9.向吸附柱 CR1 中加入 500μl 溶液 RW,12,000 rpm(~13,400×g)離心 1 min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
10.向吸附柱 CR1 中加入 600 μl 漂洗液 PW(使用前請先檢查是否已加入乙醇),12,000 rpm(~13,400×g)離心 1 min,丟棄濾液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
11.重復(fù)操作步驟 10。
12.12,000rpm(~13,400×g)離心 3 min,將吸附柱 CR1 置于室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附柱中殘余的乙醇。
注意:此步驟目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,離心后將吸附柱 CR1 在室溫放置片刻,以充分晾干。
如果有漂洗液殘留,可能會(huì)影響后續(xù)的 RT 等實(shí)驗(yàn)。
13.將吸附柱 CR1 轉(zhuǎn)入一個(gè)新的 RNase-Free 離心管中,加入 30-100 μl 無酶雙蒸水至吸附柱的膜中心,室
溫靜置 2 min,12,000 rpm(~13,400×g)離心 1 min,得到 RNA 溶液。
注意:洗脫液體積不應(yīng)少于 30μl,體積過小影響回收效率。為了增加產(chǎn)量,可將步驟 13 得到的 RNA 溶液再加入吸附柱 CR1,放置 2min,12,000rpm(~13,400×g)離心 1min,得到 RNA 溶液。RNA 溶液-70℃中保存。
附錄:從高度黏稠性的富含多酚及多糖成分的樣本中提取 RNA
樟科植物樣本,在裂解后粘稠度高、移取困難,可直接于過濾柱中進(jìn)行裂解,以減少移液器吸取的步驟。
1.將過濾柱 CS1 于冰上預(yù)冷,秤取不超過 30mg 的樣本組織,于液氮中迅速研磨,并將研磨的樣本直接轉(zhuǎn)移至預(yù)冷的過濾柱 CS1 里(過濾柱 CS1 放在收集管中)。
2.加入 600ul 裂解液 RS(已添加巰基乙醇)至過濾柱,于 60℃金屬浴孵育 10 分鐘。
3.12,000 rpm(~13,400×g)離心 5 min,將收集管中的濾液移取至新的 1.5ml 離心管,請避免吸取到沉淀物。
注意:有些樣本可能會(huì)堵塞過濾柱,可再次離心,或?qū)⒐苤惺S嗟牧呀庖阂浦列碌倪^濾柱 CS1 再次離
心。
4.加入 1/3 倍體積的溶液 GP 至濾液中,混合均勻,于冰上孵育 5 分鐘,12,000 rpm(~13,400×g)離心離心 5 min,將上清液小心轉(zhuǎn)移至新的 1.5ml 離心管,不要觸碰或移取固體沉淀。轉(zhuǎn)至上面“操作步驟5”。
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