培養(yǎng)細(xì)胞/細(xì)菌總RNA提取試劑盒品牌:genefist | 貨號(hào):GF430
選配的試劑
溶菌酶(50mg/ml)目錄號(hào):GF0203-01,客戶自備,提取細(xì)菌總 RNA 時(shí)需配備
儲(chǔ)存條件
DNase I(為DNase I 凍干粉溶解于專用保存液),儲(chǔ)存于-20℃;
其他試劑室溫(15-25℃)保存。
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
培養(yǎng)細(xì)胞/細(xì)菌總RNA提取試劑盒,提供了快速簡(jiǎn)單且有效的方法,可從培養(yǎng)細(xì)胞和細(xì)菌中提取總RNA。本試劑盒采用離心管柱的方式,配合使用我司獨(dú)特的硫氰酸胍裂解液,使細(xì)胞或細(xì)菌裂解及均質(zhì)化,并加入乙醇使RNA選擇性的與管柱膜結(jié)合,于操作過(guò)程中加入DNase Ⅰ以去除殘留的基因組DNA,經(jīng)過(guò)多次“洗滌及離心”的步驟去除污染雜質(zhì),再以無(wú)核酸酶水回收結(jié)合在管柱膜上的RNA。若RNA小于200nt,如5sRNA、tRNA和microRNA,無(wú)法在此系統(tǒng)中被有效地回收。提取的總RNA純度高,基本沒(méi)有DNA和蛋白質(zhì)污染,可用于PCR、芯片分析、Blot、PolyA 篩選、體外翻譯、RNase 保護(hù)分析和分子克隆等多種下游實(shí)驗(yàn)。
預(yù)防RNase污染,應(yīng)注意以下幾方面
1.經(jīng)常更換新手套,因?yàn)槠つw經(jīng)常帶有細(xì)菌,可能導(dǎo)致RNase污染。
2.使用無(wú)RNase的塑料制品和槍頭避免交叉污染。
3.RNA在裂解液RL中時(shí)不會(huì)被RNase降解。但提取后繼續(xù)處理過(guò)程中應(yīng)使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4 h,塑料器皿可在0.5 M NaOH中浸泡10 min,然后用水徹底清洗,再滅菌,即可去除RNase。
4.配制溶液應(yīng)使用無(wú)RNase的水(將水加入到干凈的玻璃瓶中,加入DEPC至終濃度0.1%(V/V),高壓滅菌)。
使用前注意事項(xiàng)
1.裂解液 RL:使用前請(qǐng)?zhí)砑?300ul 巰基乙醇,添加過(guò)巰基乙醇的裂解液 4℃保存。
2.漂洗液 PW:使用前請(qǐng)?zhí)砑?64ml 無(wú)水乙醇。
3.為確保 RNA 的品質(zhì)及產(chǎn)量,應(yīng)盡量收取新鮮的動(dòng)物組織進(jìn)行 RNA 提取,或?qū)⒔M織立即以液氮冷凍,儲(chǔ)存于-70℃,組織亦可保存在 RANstore 樣本保存液(目錄號(hào):TR38)中。樣本保存在 RNAstore 試劑中,可于37℃存放 1 天、4℃存放 1 個(gè)月、-20℃永久保存,所提取的 RNA 品質(zhì)與儲(chǔ)存在液氮中相同。
操作步驟
一、從培養(yǎng)細(xì)胞中提取總 RNA
1.收集細(xì)胞
a.懸浮細(xì)胞的收集(收集細(xì)胞數(shù)量請(qǐng)不要超過(guò) 1×107):估計(jì)細(xì)胞數(shù)量,300×g 離心 5 min,將細(xì)胞收集到離心管中,仔細(xì)吸除所有培養(yǎng)基上清。
b.單層貼壁細(xì)胞的收集(收集細(xì)胞數(shù)量請(qǐng)不要超過(guò) 1×107):可直接在培養(yǎng)容器中裂解(容器直徑不超過(guò)10 cm),或者使用胰蛋白酶處理后離心收集細(xì)胞沉淀。(在搖瓶中培養(yǎng)的單層貼壁細(xì)胞通常采用胰蛋白酶處理的方法。)
直接裂解法:確定細(xì)胞數(shù)量,徹底吸除細(xì)胞培養(yǎng)基上清,立即進(jìn)行第 2 步裂解步驟。
胰蛋白酶處理法:確定細(xì)胞數(shù)量,吸除培養(yǎng)基,用 PBS 洗滌細(xì)胞,吸除 PBS,向細(xì)胞中加入含有0.10-0.25%胰蛋白酶的 PBS 處理細(xì)胞,當(dāng)細(xì)胞脫離容器壁時(shí),加入含有血清的培養(yǎng)基失活胰蛋白酶,將細(xì)胞溶液轉(zhuǎn)移至 RNase-Free 的離心管中,300×g 離心 5 min,收集細(xì)胞沉淀,仔細(xì)吸除所有上清。
注意:收集細(xì)胞時(shí)一定要將細(xì)胞培養(yǎng)液去除干凈,否則會(huì)導(dǎo)致裂解不完全,影響 RNA 與吸附柱的結(jié)合,
造成 RNA 的產(chǎn)量降低;請(qǐng)勿使用過(guò)多的樣本量,避免管柱杜塞而造成 RNA 的產(chǎn)量降低。
2.裂解處理
a.對(duì)于離心得到的細(xì)胞沉淀:輕彈離心管底部,使細(xì)胞沉淀松散,加入適量裂解液 RL(詳見(jiàn)下表,使用
3.將所有溶液轉(zhuǎn)移至過(guò)濾柱 CS1 上(過(guò)濾柱 CS1 放在收集管中),12,000 rpm(~13,400×g)離心 2min,收集濾液。
4.向?yàn)V液加入等體積 70%乙醇至裂解液中,混勻(此時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)沉淀)。
5.將“裂解液/乙醇混合液”(含沉淀)移取至吸附柱 CR1 中(吸附柱 CR1 放入收集管中),12,000 rpm (~13,400×g )離心 30-60 sec,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
注意:將溶液和沉淀轉(zhuǎn)移至吸附柱 CR1 時(shí),如果體積大于吸附柱容量,可以分次完成。
6.向吸附柱 CR1 加入 500ul 溶液 RW,12,000 rpm (~13,400×g )離心離心 1 min,丟棄濾液。
7.DNase Ⅰ降解。
每一純化反應(yīng),請(qǐng)將 80 ul DNase 消化液與 10ul DNaseⅠ預(yù)先混合在新的離心管(輕彈或翻轉(zhuǎn)離心管以混合均勻,請(qǐng)勿震蕩),將 90 ul “DNaseⅠ工作液”加入至吸附柱的膜中心,于室溫(25~28℃)孵育15 分鐘。
注意:如同時(shí)操作多組樣本,請(qǐng)使用前現(xiàn)配新鮮的 DNaseⅠ工作液,請(qǐng)勿預(yù)先配制保存 DNaseⅠ工作液。
8.向吸附柱 CR1 中加入 500μl 溶液 RW,12,000 rpm(~13,400×g)離心 1 min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
9.向吸附柱 CR1 中加入 600μl 漂洗液 PW(使用前請(qǐng)先檢查是否已加入乙醇),12,000 rpm(~13,400×g) 離心 1 min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
10.重復(fù)操作步驟 9。
11.12,000 rpm(~13,400×g)離心 3 min,將吸附柱 CR1 置于室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的乙醇。
注意:此步驟目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,離心后將吸附柱 CR1 在室溫放置片刻,以充分晾干。如果有漂洗液殘留,可能會(huì)影響后續(xù)的 RT 等實(shí)驗(yàn)。
12.將吸附柱 CR1 轉(zhuǎn)入一個(gè)新的 RNase-Free 離心管中,加入 30-100 μl 無(wú)酶雙蒸水至吸附柱的膜中心,室溫靜置 2 min,12,000 rpm(~13,400×g)離心 1 min,得到 RNA 溶液。
注意:洗脫緩沖液體積不應(yīng)少于 30 μl,體積過(guò)小影響回收效率;RNA 溶液請(qǐng)于-70℃保存。
二、從細(xì)菌中提取總 RNA
1.4℃12,000 rpm(~13,400×g)離心 2 min 收集菌體(收集菌體的最大量不超過(guò) 1×109),仔細(xì)去除所有培養(yǎng)基上清,以后的所有離心步驟均在室溫(20-25℃)進(jìn)行。
注意:如果培養(yǎng)基上清去除不完全,將對(duì)第二步中的細(xì)胞壁消化過(guò)程產(chǎn)生抑制。
2.用含有溶菌酶的 100μl TE 緩沖液(客戶自己配制,配制方法見(jiàn)下表)徹底重懸菌體,孵育時(shí)間見(jiàn)下表。
3.加入 350μl 裂解液 RL(使用前請(qǐng)先檢查是否已加入β-巰基乙醇),渦旋振蕩混勻。
4.將裂解混合液轉(zhuǎn)移至過(guò)濾柱 CS1 上(過(guò)濾柱 CS1 放入收集管),12,000 rpm(~13,400×g)離心 2min,收集濾液。
5.向?yàn)V液中加入 250μl 無(wú)水乙醇,混勻(此時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)沉淀)。
6.將“裂解液/乙醇混合液”(含沉淀)移取至吸附柱 CR1 中(吸附柱 CR1 放入收集管中),12,000 rpm (~13,400×g )離心 30-60 sec,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
注意:將溶液和沉淀轉(zhuǎn)移至吸附柱 CR1 時(shí),如果體積大于吸附柱容量,可以分次完成。
7.向吸附柱 CR1 中加入 500ul 溶液 RW,12,000 rpm (~13,400×g )離心離心 1 min,丟棄濾液,將吸附柱CR1 放回收集管中。
8.DNase Ⅰ降解。
每一純化反應(yīng),請(qǐng)將 80 ul DNase 消化液與 10ul DNaseⅠ預(yù)先混合在新的離心管(輕彈或翻轉(zhuǎn)離心管以混合均勻,請(qǐng)勿震蕩),將 90 ul “DNaseⅠ工作液”加入至吸附柱的膜中心,于室溫(25~28℃)孵育15 分鐘。
注意:如同時(shí)操作多組樣本,請(qǐng)使用前現(xiàn)配新鮮的 DNaseⅠ工作液,請(qǐng)勿預(yù)先配制保存 DNaseⅠ工作液。
9.向吸附柱 CR1 中加入 500μl 溶液 RW,12,000 rpm(~13,400×g)離心 1 min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
10.向吸附柱 CR1 中加入 600μl 漂洗液 PW(使用前請(qǐng)先檢查是否已加入乙醇),12,000 rpm(~13,400×g)離心 1 min,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱 CR1 放回收集管中。
11.重復(fù)操作步驟 10。
12.12,000 rpm(~13,400×g)離心 3 min,將吸附柱 CR1 置于室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的乙醇。
注意:此步驟目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,離心后將吸附柱 CR1 在室溫放置片刻,以充分晾干。如果有漂洗液殘留,可能會(huì)影響后續(xù)的 RT 等實(shí)驗(yàn)。
13.將吸附柱 CR1 轉(zhuǎn)入一個(gè)新的 RNase-Free 離心管中,加入 30-100 μl 無(wú)酶雙蒸水至吸附柱的膜中心,室溫靜置 2 min,12,000 rpm(~13,400×g)離心 1 min,得到 RNA 溶液。
注意:洗脫緩沖液體積不應(yīng)少于 30 μl,體積過(guò)小影響回收效率;RNA 溶液請(qǐng)于-70℃保存。
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