牛肺抑肽酶是一種球形多肽單體，分子量6.5 kDa。抑肽酶常用作非特異性絲氨酸蛋白酶抑制劑，包含反向平行β片狀結構、N端310螺旋和C端和α螺旋。 氨基酸13-18的抑肽酶殘基是結合絲氨酸蛋白酶必不可少的結構。