Wako Phos-tag-用于磷酸化蛋白分析使用問(wèn)題與解答
1.???? Phos-tag? Acrylamide的溶解
5mmmol/ Phos-tag? 液體 (3v/v% 甲醇):
1)??? 10mg? Phos-tag? Acrylamide 里加入 0.1mL 甲醇
2)??? 使用槍頭攪拌混合直至完全溶解。
3)??? ?加3.2mL 蒸餾水, 用槍頭混勻。
2-8℃避光保存。不適合零度以下保存。建議保存時(shí)間6個(gè)月。
?注意:避免溶解過(guò)程出現(xiàn)白色懸浮顆粒。
2.???? α-Casein, from Bovine Milk, Dephosphorylated(038-23221),陽(yáng)性對(duì)照(含有磷酸化和非磷酸化
?α-Casein),如何使用?
?用水或者上樣buffer溶解。用水溶解后,冷凍保存。電泳條件:Phos-tag? 50umol/L,分離膠濃度 10%。
?電流:30mM,1小時(shí)。
?
3.???? 用Alkaline Phosphatase(for Biochemistry)(018-10693)進(jìn)行磷酸化蛋白的去磷酸化反應(yīng)體系。
37℃,過(guò)夜。# 10 mg/mL phosphorylated protein 50 μL
# 0.50 M Tris/HCl buffer (pH 9.0) containing 0.10 M MgCl2 10 μL
# Sterilized water 39 μL
# Alkaline phosphatase(018-10693). 0.3 unit / 1 μL有一點(diǎn)需要注意:ALP活性化使用Mg離子,相
?同的非磷酸化蛋白質(zhì)用ALP處理的樣品的條帶和沒(méi)有用ALP處理的樣品的條帶的位置不同。
?
4.???? Phos-tag? SDS-PAGE實(shí)驗(yàn)沒(méi)有成功分離磷酸化蛋白:
1) 使用α-Casein, from Bovine Milk, Dephosphorylated(038-23221)作為陽(yáng)性對(duì)照,確認(rèn)實(shí)驗(yàn)條
件和試劑均沒(méi)有問(wèn)題。
2) 可使用Phos-tag?Biotin檢測(cè)樣品中是否有磷酸化蛋白。確認(rèn)有磷酸化蛋白后,再通過(guò)
Phos-tag ?SDS-PAGE進(jìn)行分離鑒定。
3) 經(jīng)質(zhì)譜鑒定有表達(dá)磷酸化蛋白,建議增大樣品的含量,可使用Phos-tag ?Agarose進(jìn)行磷酸化蛋白
的富集。磷酸化蛋白含量過(guò)低,會(huì)影響其分離效果。
4) 文獻(xiàn)報(bào)道有表達(dá)磷酸化蛋白,或者同源蛋白有表達(dá)磷酸化蛋白的,建議用Phos-tag? Biotin先確認(rèn)
樣品中是否有磷酸化蛋白。
5) 建議樣品的pH值在7左右。酸性或者堿性條件下,Mn2+-Phos-tag?與磷酸化基團(tuán)的特異性結(jié)合較
差。
6) 避免樣品中含有高濃度的還原劑,變性劑,表面活性劑等。β-巰基乙醇濃度不高于0.2M(或者5%)。
7) 進(jìn)行Phos-tag? SDS-PAGE的佳樣品是純化的蛋白。如果是細(xì)胞裂解液,體外激酶反應(yīng)液,組織均
漿液等,需要摸索佳的分離膠,Phos-tag? Acylamide的濃度。建議Phos-tag? Acrylamide濃度
從50uM開始摸索。
?
5.???? Phos-tag?SDS-PAGE凝膠用于Western Blotting實(shí)驗(yàn)的優(yōu)化建議:
1) 可以檢測(cè)的樣品包括體外激酶反應(yīng)體系,細(xì)胞裂解液,組織均漿液。
2) 每孔樣品的上樣量是10~30ug(請(qǐng)根據(jù)蛋白表達(dá)量進(jìn)行調(diào)整)
3) 制備樣品中含有的還原劑、變性劑、螯合劑、釩酸等會(huì)使電泳條帶發(fā)生彎曲或者拖尾。通過(guò)TCA沉淀或
滲析法降低雜質(zhì)含量。
4) 建議樣品的pH值在7左右。如果加入上樣緩沖液后溶液顯黃色或者橙色,加入Tris緩沖液調(diào)整pH值為7。
5) 目的蛋白分子量大于60kDa,分離膠的丙烯酰胺濃度為6%;目的蛋白分子量小于60kDa,分離膠的丙烯
酰胺濃度為8%。
6) 如果樣品中含有大量蛋白,比如細(xì)胞裂解液,組織均漿液,Phos-tag? Acylamide濃度為5~25uM。
若目的蛋白濃度低,建議Phos-tag? Acylamide濃度為100uM。
7) Phos-tag ?SDS-PAGE凝膠用于Western Blotting實(shí)驗(yàn),濕法轉(zhuǎn)膜建議:10mM EDTA的轉(zhuǎn)移緩沖液
處理凝膠10min,不含有EDTA的轉(zhuǎn)移緩沖液處理凝膠10min。重復(fù)3次。強(qiáng)烈建議濕法轉(zhuǎn)膜
8) Phos-tag? SDS PAGE半干法轉(zhuǎn)膜建議:
????????????? i.????? 電泳后用含有EDTA的轉(zhuǎn)移緩沖液處理凝膠,EDTA的濃度為 100mM。100mM EDTA的轉(zhuǎn)移
緩沖液處理凝膠10min,不含有EDTA的轉(zhuǎn)移緩沖液處理凝膠10min。重復(fù)3次。
???????????? ii.????? 轉(zhuǎn)膜的電流值提高2%~3%, 延長(zhǎng)時(shí)間2成。
??????????? iii.????? 轉(zhuǎn)膜的緩沖液加SDS,加到大約0.05~0.2%,轉(zhuǎn)膜效率會(huì)提高。
9) 使用目的蛋白的非磷酸化抗體即可。比如檢測(cè)各種腫瘤細(xì)胞系中Src激酶活性實(shí)驗(yàn),用Src的非磷酸化抗
體即可。
10) 和光的WIDE-VIEWTM Prestained Protein Siza MarkerIII(230-02461)可檢測(cè)作為轉(zhuǎn)膜效率,但是無(wú)
法判斷分子量。
11) 一般預(yù)染的蛋白marker在Phos-tag?SDS-PAGE中條帶會(huì)彎曲,無(wú)法判斷蛋白分子量。
12) 不能確認(rèn)磷酸化蛋白和非磷酸化蛋白的分離,請(qǐng)進(jìn)行常規(guī)的SDS-PAGE,Western Blotting實(shí)驗(yàn)。比
對(duì)目的蛋白的遷移率。
13) 不能確認(rèn)是因?yàn)榈鞍装l(fā)生磷酸化還是出現(xiàn)降解造成蛋白條帶遷移,請(qǐng)進(jìn)行常規(guī)的SDS-PAGE實(shí)驗(yàn),確
認(rèn)不會(huì)出現(xiàn)條帶遷移。
14) 目的蛋白磷酸化與非磷酸化分離效果不佳,使用α-Casein, from Bovine Milk, Dephosphorylated
(038-23221)作為陽(yáng)性對(duì)照,確認(rèn)實(shí)驗(yàn)條件和試劑均沒(méi)有問(wèn)題。如果確認(rèn)能夠分離,調(diào)整分離膠,
Phos-tag? Acylamide的濃度。建議使用品質(zhì)佳的MnCl2(139-00722)。
產(chǎn)品編號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品規(guī)格 | 產(chǎn)品等級(jí) |
304-93526 | ?Phos-tag?Acrylamide?AAL-107 5mM?Aqueous?Solution?Phos-tag?丙烯酰胺5mM水溶液 |
0.3mL | 蛋白研究 |
300-93523 | ?Phos-tag?Acrylamide?AAL-107 Phos-tag?丙烯酰胺 |
2mg | 蛋白研究 |
304-93521 | ?Phos-tag?Acrylamide?AAL-107 Phos-tag?丙烯酰胺 |
10mg | 蛋白研究 |
134-15302 | Manganese(II)?Chloride?Tetrahydrate氯化錳四水合物 | 25g | for?Molecular?Biology |