本品是對應(yīng)5-hydroxymethylcytosine的單抗，能用于Hydroxymethylated DNA IP (hMeDIP)分析。

背景

5-hydroxymethylcytosine是最近發(fā)現(xiàn)的修飾堿基，由于oxygenase的運(yùn)動，從5-methylcytosine(5-mC)被轉(zhuǎn)換成5-hydroxymethylcytosine(5-hmC)。

??? 5-hmC作為第六個(gè)堿基在生物體內(nèi)有什么作用還不明朗，但是，普遍認(rèn)為它與5-hmC起不同的重要作用。使用普通的硫酸氫鈉法不能區(qū)別5-mC和5-hmC，所以急需找到可以特異性檢測5-hmC的方法。要分別5-mC、5-hmC的序列，利用抗體反應(yīng)親和性的技術(shù)比較有效，還可以作為特異性的濃縮方法。2

例1

【辨別Dual MeDIP：5-mC和5-hmC】

把基因組DNA用超聲波處理，片段化到300 ～ 500 bp，用5-hydroxymethylcytosine antibody (5-hmC抗體：本品)進(jìn)行羥甲基化DNA IP分析(hMeDIP)。同時(shí)對hMeDIP的非結(jié)合分層部分，用5-methylcytosine antibody(5-mC抗體)進(jìn)行甲基化DNA IP分析(MeDIP)。

例2

【和其他公司產(chǎn)品比較】

對5-hydroxymethylcytosine使用2種抗體：“Diagenode公司的單抗(本品)”和“其他公司產(chǎn)品的多抗”進(jìn)行羥甲基化DNA IP分析(hMeDIP)。在hMeDIP里使用了Diagenode公司的hMeDIP kit。

橙字：Diagenode公司產(chǎn)品單抗

黑字：其他公司單抗

例3

【對單鏈DNA和雙鏈DNA進(jìn)行羥甲基化DNA IP分析（hMeDIP）的有效性】

使用5-hydroxymethylcytosine抗體，進(jìn)行hMeDIP。作為陰性對照，使用小鼠IgG。使用1μg 由hMeDIP kit(Diagenode公司)的GenDNA module制備的ES細(xì)胞(E14)的DNA，經(jīng)BioruptorR進(jìn)行超聲波處理，片段化到300-500bp。

而經(jīng)免疫沉淀得到的DNA，可使用Sfi1 (splicing factor 1) gene的引物對進(jìn)行定量PCR的分析。

例4

【用點(diǎn)印跡法時(shí)Diagenode公司的5-hmC抗體的特異性】

用5-hmC(1)和5-hmC(2)、C(3)作為各自的底物的PCR產(chǎn)物，經(jīng)2~200ng(各自含有0.1~10pmol的C堿基)的膜進(jìn)行點(diǎn)印跡。

在5-hmC抗體里(4μg/ml(稀釋倍率1:500))孵育膜。膜暴光30秒。

數(shù)據(jù)資料

5-hydroxymethylcytosine antibody (diagenode社英語版)

刊登的試劑只使用于試驗(yàn)·研究目的，不能作為“醫(yī)藥品”、“食品”、“家庭用品”等使用。