ChIP-Seq 核裂解液,常用生化試劑

ChIP-Seq 核裂解液品牌:JinPan | 貨號:JP-8145-100ml

ChIP-Seq Nuclear Lysis buffer

【保存條件】 

-20 ℃保存,有效期 12 個月 

【概述】 

本品適用于小片段(5-500bp)單鏈 DNA 的雜交反應,獲得更優(yōu)質的雜交雙鏈 DNA 片段,如 shRNA、gRNA 載體等構建。 

【操作方法】 

1. 收獲細胞核后,將細胞核重懸于 3-5 倍體積的冰冷的 ChIP-Seq 核裂解緩沖液中(5 倍體積取決于細胞核 提取過程中細胞裂解液用量,如細胞裂解液用量為 100μl 則加入 500μl ChIP-Seq 核裂解液) 

2. 將試管在冰上孵育 20 分鐘。 

3.從每個樣品中取 5 μL 等分試樣,并用 15 μL TE 稀釋以用于分析凝膠確認。(注:將剩余保存在冰上或 凍-20 ℃,直到需要為止。該樣品用于確認染色質在分離前是完整的。) 

4. 將試管放入設定為 2°C 的超聲浴中, 調節(jié)水位,使管子剛好接觸杯墊的表面。。 如用 Misonix 431A 對每個試管進行 300 μl 的超聲處理非常穩(wěn)定,因此我們建議將較大的樣品分成多個試管進行超聲處理。將至少兩個和多達 8 個試 管放入超聲儀的試管支架中。 

5. 用 10 秒的脈沖和 10 秒的靜止時間以 20 的振幅對樣品進行超聲處理,總超聲時間為 30 分鐘。 

6. 從超聲儀中取出樣品,并保存在冰上。 

7. 取 5 μl 樣品,并用 15 μl TE 稀釋以用于分析凝膠。 

8. 在 37°C 下,用 10 μg RNase A 樣品 15 分鐘。 

9. 在 65°C 下用 20 μg 蛋白酶 K 樣品 30 分鐘。 

10. 在 95°C 下反向交聯 5 分鐘,使樣品緩慢冷卻至室溫。 需要執(zhí)行這些步驟以確保 DNA 在瓊脂糖凝膠上的正確遷移。否則,將發(fā)生比預期高得多的分子量的涂污或遷移。 

11. 將加樣染料添加到每個樣品中,并在 TAE 運行緩沖液中的 1%瓊脂糖凝膠上分離樣品。 

12. 凝膠成像儀下觀察瓊脂糖凝膠上的 DNA 樣品。 剪切染色質的大小應在 200 至 500 bp 之間。 

13. 若步驟 12 完成后鑒定可行,將步驟 6 中其余樣品在 4°C 下以 16,000 g 的速度離心 10 分鐘,以去除不 溶物。 

14. 將可溶的剪切染色質轉移到新鮮的 1.5ml 離心管中。 染色質可以在液氮中冷凍,并在-80°C 下保存直至需要。 

15.按上述方法用 RNase A,蛋白酶 K 和交聯逆轉處理等分試樣(步驟 8-10)。 

16.使用 QIAquick PCR 純化試劑盒純化染色質,并使用 NanoDrop 等測量 DNA 濃度。 

【注意事項】 

1. 如果每次的使用量很小,可以適當分裝后再使用,以免污染。 

2. 為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。

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