ChIP-Seq 核裂解液品牌:JinPan | 貨號(hào):JP-8145-100ml
ChIP-Seq Nuclear Lysis buffer
【保存條件】
-20 ℃保存,有效期 12 個(gè)月
【概述】
本品適用于小片段(5-500bp)單鏈 DNA 的雜交反應(yīng),獲得更優(yōu)質(zhì)的雜交雙鏈 DNA 片段,如 shRNA、gRNA 載體等構(gòu)建。
【操作方法】
1. 收獲細(xì)胞核后,將細(xì)胞核重懸于 3-5 倍體積的冰冷的 ChIP-Seq 核裂解緩沖液中(5 倍體積取決于細(xì)胞核 提取過(guò)程中細(xì)胞裂解液用量,如細(xì)胞裂解液用量為 100μl 則加入 500μl ChIP-Seq 核裂解液)
2. 將試管在冰上孵育 20 分鐘。
3.從每個(gè)樣品中取 5 μL 等分試樣,并用 15 μL TE 稀釋以用于分析凝膠確認(rèn)。(注:將剩余保存在冰上或 凍-20 ℃,直到需要為止。該樣品用于確認(rèn)染色質(zhì)在分離前是完整的。)
4. 將試管放入設(shè)定為 2°C 的超聲浴中, 調(diào)節(jié)水位,使管子剛好接觸杯墊的表面。。 如用 Misonix 431A 對(duì)每個(gè)試管進(jìn)行 300 μl 的超聲處理非常穩(wěn)定,因此我們建議將較大的樣品分成多個(gè)試管進(jìn)行超聲處理。將至少兩個(gè)和多達(dá) 8 個(gè)試 管放入超聲儀的試管支架中。
5. 用 10 秒的脈沖和 10 秒的靜止時(shí)間以 20 的振幅對(duì)樣品進(jìn)行超聲處理,總超聲時(shí)間為 30 分鐘。
6. 從超聲儀中取出樣品,并保存在冰上。
7. 取 5 μl 樣品,并用 15 μl TE 稀釋以用于分析凝膠。
8. 在 37°C 下,用 10 μg RNase A 樣品 15 分鐘。
9. 在 65°C 下用 20 μg 蛋白酶 K 樣品 30 分鐘。
10. 在 95°C 下反向交聯(lián) 5 分鐘,使樣品緩慢冷卻至室溫。 需要執(zhí)行這些步驟以確保 DNA 在瓊脂糖凝膠上的正確遷移。否則,將發(fā)生比預(yù)期高得多的分子量的涂污或遷移。
11. 將加樣染料添加到每個(gè)樣品中,并在 TAE 運(yùn)行緩沖液中的 1%瓊脂糖凝膠上分離樣品。
12. 凝膠成像儀下觀察瓊脂糖凝膠上的 DNA 樣品。 剪切染色質(zhì)的大小應(yīng)在 200 至 500 bp 之間。
13. 若步驟 12 完成后鑒定可行,將步驟 6 中其余樣品在 4°C 下以 16,000 g 的速度離心 10 分鐘,以去除不 溶物。
14. 將可溶的剪切染色質(zhì)轉(zhuǎn)移到新鮮的 1.5ml 離心管中。 染色質(zhì)可以在液氮中冷凍,并在-80°C 下保存直至需要。
15.按上述方法用 RNase A,蛋白酶 K 和交聯(lián)逆轉(zhuǎn)處理等分試樣(步驟 8-10)。
16.使用 QIAquick PCR 純化試劑盒純化染色質(zhì),并使用 NanoDrop 等測(cè)量 DNA 濃度。
【注意事項(xiàng)】
1. 如果每次的使用量很小,可以適當(dāng)分裝后再使用,以免污染。
2. 為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
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